پس از افشای این گزارش از سوی این پایگاه اینترنتی آمریکایی، پرونده نوآم چامسکی در سیا که پس از مدت‌ها این پایگاه اینترنتی براساس یک درخواست مبتنی بر قانون آزادی اطلاع رسانی در آمریکا اجازه دسترسی به آن را گرفته بود در بایگانی لانگلی متعلق به سیا حذف شده و از بین رفته است.
این مساله این پرسش را مطرح کرده که این پرونده چه زمانی از بین رفته و با اختیار چه کسی این کار انجام شده است.
افشای پرونده نوآم چامسکی در سیا بر اساس درخواستی مبتنی بر قانون آزادی اطلاع رسانی از پلیس اف بی آی آمریکا انجام شده است البته این نخستین بار نبوده که این درخواست به منظور دسترسی به این پرونده مطرح شده است.
در سال‌های گذشته چندین بار این درخواست‌ها براساس قانون آزادی اطلاع رسانی مطرح شده بودند اما همه آنها رد می‌شدند.
از بین بردن پرونده نوآم چامسکی مناقشه برانگیز است زیرا براساس قانون اسناد فدرال آمریکا متعلق به سال 1950 باید درخواست از بین بردن اسناد به تایید اداره بایگانی ملی آمریکا رسیده باشد تا اسناد از بین بروند.
مقامات این اداره معمولا به این درخواست‌ها پاسخ منفی می‌دهند زیرا اداره بایگانی وظیفه حفظ اسناد دارای ارزش تاریخی را دارند.
ایتان تئوهریس، یک کارشناس همکاری‌های سیا و پلیس اف بی آی و همچنین کارشناس جمع آوری اطلاعات اظهار داشت که صراحتا پرونده‌های سیا در خصوص نوآم چامسکی مشمول این شرایط می‌شوند.
نوآم چامسکی در اظهارنظری در خصوص این افشاگری گفت که روزی سرانجام همه پی خواهند برد که نظام‌های قدرت عموما تلاش دارند تا به هر شکلی که بتوانند فکرش را بکنند قدرت خود را گسترش دهند.
افشای مساله جاسوسی سیا علیه نوآم چامسکی زنگ خطر را برای همه کسانی که رسوایی‌های گوناگون نقض حریم خصوصی دولت فدرل آمریکا را دنبال می‌کرده‌اند به صدا درخواهد آورد.
بسیاری از پرسش‌ها در خصوص پرونده محرمانه سیا درباره نوآم چامسکی بی‌پاسخ مانده است به عنوان مثال جاسوسی‌های دولتی در آمریکا علیه شهروندان آمریکایی تا کجا می‌توانند ادامه پیدا کنند؟ چه کسی پرونده وی را از بین برده است و به چه علت؟ چه چیزهای دیگر ممکن است از بین رفته باشند؟